市交通运输局贯彻落实中央关于交通运输工作的方针政策和省委、苏州市委、昆山市委的决策部署，在履行职责过程中坚持和加强党对交通运输工作的集中统一领导。主要职责是：
1. 贯彻执行党和国家有关交通运输的方针政策、法律法规，组织起草交通运输地方性实施意见和规范性文件；拟订交通运输行业有关政策并监督实施，实施交通运输行业体制改革工作。
2. 组织编制全市综合运输体系规划，组织拟订并监督实施全市公路、航道、港口、城乡客运和交通物流业等行业发展规划，参与拟订地方铁路、轨道交通、民用航空、综合交通运输枢纽的建设规划。会同有关部门编制交通运输固定资产投资计划。负责交通运输行业统计和信息发布工作。
3. 组织实施市级公路、水运工程建设。负责全市公路、水运工程建设和维护的行业管理。负责全市公路、水运工程市场的监督和管理，监督全市公路、水运工程的质量与安全。负责港口岸线、陆域、水域交通运输的统一管理工作。
4. 承担全市道路、水路运输市场管理职责。负责城乡公共汽车、客运出租汽车和轨道交通运营行业管理工作。指导交通运输枢纽管理工作。拟定有关交通物流业政策和标准并监督实施。
5. 负责全市交通运输综合行政执法工作。负责全市通航水域的水上交通安全监督，组织协调内河救助打捞工作。负责船舶污染防治监督管理工作，协助做好船舶检验工作。
6. 贯彻落实省关于交通运输行业的投融资政策和规费政策并监督实施。协调并参与交通运输建设资金筹集。负责交通运输预算资金的申请、拨付和监管。负责交通运输行业内部审计、内管干部经济责任审计工作，监督管理局属企业国有资产。
7. 拟订全市交通运输行业科技与信息化政策、规划和规范并组织实施，组织重大交通科技项目攻关。指导协调交通运输行业信息化项目的建设与管理。指导并监督交通运输行业科学技术、环保、节能减排工作。
8. 负责全市交通运输行业安全生产的监督管理。承担并指导全市交通运输行业应急处置工作。组织实施重点物资运输和紧急运输。组织协调节假日运输等重大交通保障工作。
9. 承担全市地方铁路建设项目的组织协调工作。承担全市民用航空的相关管理和服务工作。承担市国防动员委员会交通战备办公室工作。
10. 指导全市交通运输行业队伍建设、精神文明建设、作风建设工作。负责局属单位党、工、团、妇女工作。指导全市交通运输行业利用外资和对外交流合作。协调交通运输行业对台服务工作。
11. 宣传贯彻安全生产、消防安全、环境保护和生态文明建设等方面的法律法规和方针政策，并认真履行好相关工作职责和责任。
12. 完成市委、市政府交办的其它任务。
13. 职能转变。深化相对集中行政许可权改革，建立行政审批与监管协调联动制度。市行政审批局负责划转事项的行政审批过程和结果，并将相关信息同步推送至市交通运输局，市交通运输局在市行政审批局行使行政许可权过程中提供法律法规、政策依据、技术服务等综合支撑，按照审批结果及时开展事中事后监管，承担监管主体责任。
14. 与市农业农村局的有关职责分工。市交通运输局做好渔船检验相关衔接工作，市农业农村局负责渔船检验和监督管理工作。
